Согласно действующему Порядку выдачи исполнительных листов в Арбитражном суде г.Москвы, исполнительные листы оформляются автоматически и отправляются по адресу, указанному в ЕГРЮЛ. Появление информации на сайте арбитражного суда, свидетельствует о том, что исполнительный лист оформлен. Получить более точную информацию по отправке/выдаче исполнительного листа Вы можете у помощника судьи.

Подать уточненное исковое заявление с новыми реквизитами юр. лица. По тексту искового заявления указать о смене наименования юр. лица.

Вправе отказаться от части исковых требований (в связи с оплатой), подать уточненное исковое заявление.

Да, можете. В порядке возврата госпошлины или взыскать с ответчика.

Целесообразно дождаться вступления в законную силу решения суда. А вообще истец вправе изначально требовать присуждения неустойки по день фактического исполнения обязательства.

Любое ненадлежащее оформление документов может усложнить процесс.

Целесообразно отправить по юридическому и фактическому адресу. Досудебный порядок считается соблюденным, если претензия отправлена по юридическому адресу. При несоблюдении претензионного порядка исковое заявление подлежит возвращению судом, а в случае принятия к производству - оставлению без рассмотрения.
В судебной практике есть случаи признания претензионного порядка соблюденным и при отправке на почтовый адрес (приложить, как минимум, доказательство ее вручения), но если хотите избежать возможной судебной волокиты в связи с данным вопросом, отправить все же дополнительно на юр. адрес, тем более почтовый даже не указан в договоре.

Информация об оформлении исполнительного листа отражается на сайте арбитражного суда в картотеке дел. Отражается в картотеке по мере готовности. В том числе и по делам, рассматриваемым в порядке упрощенного производства.

В случае прекращения производства по делу госпошлина подлежит возврату. Расходы на госпошлину могут быть возложены и на ответчика, если в заявлении указать, что требования истца удовлетворены после обращения последнего в суд и принятия искового заявления к производству.