1. форма Р13001 - 2 экз. (1 экз. нотариальный + 1 экз. подписанный)
2. форма Р14001 - 2 экз. (1 экз. нотариальный + 1 экз. подписанный)
3. устав - новая редакция 3 экз.
4. госпошлина - 800 рублей
5. протокол общего собрания учредителей - 2 экз.
6. протокол заседания совета - 2 экз.
7. заявление о приеме нового учредителя - 2 экз.
8. устав - оригинал действующей редакции (сдается в обмен на новую редакцию)
9. нотариальная доверенность - если подает документы лицо по доверенности.

Если не заполнить на Президента, то как раз он и будет осуществлять только представительские функции по доверенности от Ген. директора.
А вот, если заполнить, то и Президент сможет осуществлять полномочия, установленные уставом организации, без доверенности. В уставе тоже обязательно прописываем право президента действовать без доверенности.
В ЕГРЮЛ содержаться сведениях о всех лицах, имеющих право без доверенности действовать от имени юридического лица.

всё что касается целей, направлений и видов деятельности, а также названий у Минюста свое субъективное мнение.
запросто могут написать отказ по названию, например, на основании ст. 4 ФЗ-НКО - 1. Некоммерческая организация имеет наименование, содержащее указание на ее организационно-правовую форму и характер деятельности. Вот, по мнению Минюста, не отражает Ваше название характеру деятельности и всё равно ему, если учредители считают по другому.

полностью с Вами согласна, надо почаще жаловаться, но клиенты не особо горят желанием, им проще подстроиться под требования, чтобы только зарегистрироваться

эти приливы и отливы у Минюста МОСКВЫ каждый день, ничему не удивляюсь

конечно, идеально, когда музей ЧУ
но в их случае предложите им преобразоваться в АНО
АНО может быть музеем, я регистрировала такие организации

Так и говорите, что на основании гражданского кодекса соучредительство в ЧУ запрещено с 1 сентября 2014 года.
Учреждение, созданное до 01.09.2014 несколькими лицами, не подлежит ликвидации и может быть преобразовано в АНО или фонд.
Если клиенты преобразовываться не хотят, то тогда либо пусть работают и дальше, но со старым адресом это маловероятно, либо пусть ликвидируются, других вариантов законодательство не дает.
У них не образовательное ЧУ?

если бы в уставе были продублированы коды оквэд, то тогда да, необходимо было бы вносить доп. коды в устав и утверждать новую редакцию, а в Вашем случае нет такой необходимости, НО только в том случае, если дополнительные коды соответствуют деятельности организации и они прописаны в целях или направлениях ну хотя бы в общих чертах - например, Вы хотите добавить код - деятельность спортивных объектов и в уставе у Вас прописано - спортивная деятельность, или физкультурно-оздоровительная деятельность и т.д., то тогда нет проблем
просто у НКО в отношении оквэдов всё строго, но ещё и зависит от специалиста, к которому попадут документы

у Вас членская организация, где состав членов может меняться внутренним решением, чтобы можно было ликвидировать НП, я бы приняла нового члена, чтобы было, как минимум, двое реальных членов и от их имени приняла решение о ликвидации, а дальше назначаете ликвидатора или ликвидационную комиссию, которые проведут процедуру закрытия компании.
члена, который пропал, можно исключить, например, по следующим причинам -  систематического невыполнения своих обязанностей, не уплаты членского взноса, непосещения более двух раз Общего собрания членов без уважительной причины, при соблюдении регламента его созыва  и т.д. (какую бы причину не пропишите, желательно, чтобы было документально подтверждено, в случае чего).

1. Протоколом заседания Совета принимаются следующие вопросы - изменения наименования, изменения структуры органов организации, внесение изменений в устав.
2. Либо протоколом общего собрания учредителей (если несколько учредителей), либо решением (если один учредитель) принимается вопрос о принятии нового учредителя, т.к. по закону об нко ст. 15 - 4. Если иное не предусмотрено федеральным законом и уставом юридического лица, физические и (или) юридические лица вправе войти в состав учредителей (участников) некоммерческой корпорации, в состав учредителей фонда и автономной некоммерческой организации с согласия других учредителей и (или) участников.
3. вносите изменения в устав
4. заполняете форму Р13001 - титульный лист, лист А (название), лист М (заявитель)
5. заполняете форму Р14001 - титульный лист, лист Д (сведения о новом учредителе), лист Р (заявитель)
Если учредители прописаны в уставе, то форма 14 не заполняется и не подается, всё заполняете в 13 форме.
6. оплачиваете госпошлину - 800 рублей
7. оформляете заявление о принятии в состав учредителей от имени нового учредителя - простая письменная форма.

Либо прописываем в направлениях, но  чаще всего пишем так - НКО в рамках уставной деятельности и в соответствии с действующим законодательством РФ осуществляет следующие виды деятельности....и перечисляем все оквэды, указанные в форме и соответствующие целям организации.
Это не наша инициатива, а инициатива Минюста Москвы.