это отличная новость, потому что законодательство такие частные учреждения получается лишило дальнейшей деятельности, что неправильно, очень хорошо, что Минюст пересмотрел свою позицию и дал им шанс работать дальше, как ЧУ  

может
В случае выявления некоммерческой организации, осуществляющей деятельность в качестве некоммерческой организации, выполняющей функции иностранного агента, которая не подала заявление о включении ее в реестр некоммерческих организаций, выполняющих функции иностранного агента, Минюст России включает такую некоммерческую организацию в указанный реестр.

боюсь, не пройдет без устава, у Минюста не бывает ничего "на будущее", они смотрят из ситуации, которая складывается сейчас, а сейчас, т.к. принимается новый учредитель, в организации уже два учредителя, соответственно, ВОУ уже не единственный учредитель, а - общее собрание учредителей
понимаю, что не хочется по 10 раз менять устав, это правда, несерьезно, но я бы не рисковала

видимо для сокращения влияния иностранных государств на политику нашей страны.
если НКО получает денежные средства от иностранных государств, фондов и т.п., и одновременно занимается политикой, то есть бореться за власть, то оно обязано проинформировать об этом государство и граждан. Т
таким образом, в рамках закона обеспечивается прозрачность финансирования некоммерческих организаций и прозрачность деятельности иностранных государств на территории России.

только через содействие, т.к. фонд строить не может, а может лишь финансировать на строительство

а высший орган управления в уставе какой?

Дополнительный обязанности следующие:
1. материалы, издаваемые и (или) распространяемые такой организацией, в том числе через средства массовой информации и (или) с использованием информационно-телекоммуникационной сети «Интернет», должны сопровождаться указанием на то, что эти материалы изданы и (или) распространены некоммерческой организацией, выполняющей функции иностранного агента.

2 обязаны представлять в Минюст России дополнительную отчетность, установленную приказом Минюста России от 16.04.2013 № 50 «О форме и сроках представления в Министерство юстиции Российской Федерации отчетности некоммерческих организаций, выполняющих функции иностранного агента»:

- отчет о своей деятельности, о персональном составе руководящих органов - один раз в полгода не позднее 15-го числа месяца, следующего за окончанием полугодия (15 января, 15 июля), в том числе путем размещения в информационно-телекоммуникационной сети «Интернет» или предоставления средствам массовой информации для опубликования;

- отчет о целях расходования денежных средств и использования иного имущества, в том числе полученных от иностранных источников, и о фактическом расходовании и использовании денежных средств и иного имущества, полученных от иностранных источников, - ежеквартально не позднее 15-го числа месяца, следующего за окончанием квартала (15 января, 15 апреля, 15 июля, 15 октября);

- аудиторское заключение по итогам аудита годовой бухгалтерской (финансовой) отчетности - ежегодно не позднее 15 апреля года, следующего за отчетным.

Получение Минюстом России указанных документов подтверждается уведомлением, которое выдается некоммерческой организации (в случае непосредственного представления) или в течение трех рабочих дней с даты их представления направляется в виде почтового отправления или в электронной форме.

да, установленного образца, может быть подано:
-одновременно с документами, необходимыми для государственной регистрации некоммерческой организации при ее создании, предусмотренными пунктом 5 статьи 13.1 Федерального закона "О некоммерческих организациях", частью шестой статьи 21 Федерального закона "Об общественных объединениях" - в орган, принимающий решение о государственной регистрации некоммерческой организации;
-до начала осуществления некоммерческой организацией, указанной в пункте 7 статьи 32 Федерального закона "О некоммерческих организациях", части шестой статьи 29 Федерального закона "Об общественных объединениях", деятельности в качестве некоммерческой организации, выполняющей функции иностранного агента, - в Министерство.

Заявление о включении некоммерческой организации в реестр представляется в Министерство или его территориальный орган непосредственно либо в виде почтового отправления с описью вложения, либо в форме электронных документов с использованием информационно-телекоммуникационной сети Интернет, в том числе через Единый портал государственных и муниципальных услуг (функций).

ст. 2 ФЗ-7 "О НКО" - Некоммерческая организация, за исключением политической партии, признается участвующей в политической деятельности, осуществляемой на территории Российской Федерации, если независимо от целей и задач, указанных в ее учредительных документах, она осуществляет деятельность в сфере государственного строительства, защиты основ конституционного строя Российской Федерации, федеративного устройства Российской Федерации, защиты суверенитета и обеспечения территориальной целостности Российской Федерации, обеспечения законности, правопорядка, государственной и общественной безопасности, обороны страны, внешней политики, социально-экономического и национального развития Российской Федерации, развития политической системы, деятельности государственных органов, органов местного самоуправления, законодательного регулирования прав и свобод человека и гражданина в целях оказания влияния на выработку и реализацию государственной политики, формирование государственных органов, органов местного самоуправления, на их решения и действия.
Указанная деятельность осуществляется в следующих формах:

участие в организации и проведении публичных мероприятий в форме собраний, митингов, демонстраций, шествий или пикетирований либо в различных сочетаниях этих форм, организации и проведении публичных дебатов, дискуссий, выступлений;

участие в деятельности, направленной на получение определенного результата на выборах, референдуме, в наблюдении за проведением выборов, референдума, формировании избирательных комиссий, комиссий референдума, в деятельности политических партий;

публичные обращения к государственным органам, органам местного самоуправления, их должностным лицам, а также иные действия, оказывающие влияние на деятельность этих органов, в том числе направленные на принятие, изменение, отмену законов или иных нормативных правовых актов;

распространение, в том числе с использованием современных информационных технологий, мнений о принимаемых государственными органами решениях и проводимой ими политике;

формирование общественно-политических взглядов и убеждений, в том числе путем проведения опросов общественного мнения и обнародования их результатов или проведения иных социологических исследований;

вовлечение граждан, в том числе несовершеннолетних, в указанную деятельность;

финансирование указанной деятельности.

К политической деятельности не относятся деятельность в области науки, культуры, искусства, здравоохранения, профилактики и охраны здоровья граждан, социального обслуживания, социальной поддержки и защиты граждан, защиты материнства и детства, социальной поддержки инвалидов, пропаганды здорового образа жизни, физической культуры и спорта, защиты растительного и животного мира, благотворительная деятельность.

За неподачу заявления о включении организации в реестр деятельность организации может быть приостановлена на срок не более полугода.

Злостное уклонение от исполнения обязанностей по представлению документов, необходимых для включения в реестр некоммерческих организаций, выполняющих функции иностранного агента, наказывается штрафом в размере до трехсот тысяч рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период до двух лет, либо обязательными работами на срок до четырехсот восьмидесяти часов, либо исправительными работами на срок до двух лет, либо лишением свободы на тот же срок (ст. 330.1 Уголовного кодекса Российской Федерации).