не обязательно

выписку из реестра членов подписывают, как правило, председатель и секретарь общего собрания членов, плюс печать обязательно, выписка, более 1 стр., должна быть прошита, пронумерована и заверена заявителем и печатью организации

конечно, но тогда выписку из реестра членов обязательно приложить к протоколу

копия договора аренды (или субаренды) с приложениями (при наличии), заверенная заявителем и печатью организации

я не знаю официальной позиции Минюста по данному вопросу, но смею предположить, что, в Ассоциации учредители выступают только на моменте создания организации и после регистрации автоматически становятся членами, которые, в свою очередь, меняются в соответствие с внутренним решением уполномоченного уставом Ассоциации органа  

если, в случае ликвидации, НКО исключена из реестра Минюста (а бывает и такое, что компания ликвидирована, а в реестре Минюста не исключена), то можете использовать её наименовании для регистрации новой НКО, но обязательно проверьте, нет ли ранее зарегистрированной НКО с таким же названием

нет, организационно-правовая форма в сокращенном наименовании всё равно должна присутствовать

нет, сокращенное должно отражать полное, в Вашем случае, можно, например, так - АНО "ЦКД "Ромашка"

да, документы подаются в УФНС  

Всё можно сделать одним этапом, кроме вывода/ввода учредителей (выход учредителя через УФНС, ввод учредителей в Ассоциацию Минюст не пропускает, поэтому данные лица вступают в организацию, как члены на основании внутреннего решения уполномоченного по уставу органа).
В Минюст подается следующий комплект документов:
1. форма 13001 -2 экз., 1 экз. - нотариальный, 1 экз.- просто подписанный заявителем
2. форма 14001 -2 экз., 1 экз. - нотариальный, 1 экз.- просто подписанный заявителем
3. протокол общего собрания членов - 2 экз. (+ желательно подать выписку из реестра членов (тоже 2 экз.))
4. устав - оригинал действующей редакции
5. устав с изменениями - 3 экз.
6. госпошлина  - 800 рублей
7. документы на новый адрес - 1 экз.