Теперь понятно. Я думал все документы сначала формируются в регистрационное дело в  МИФНС 46, а потом после государственной регистрации дело передаётся в территориальную инспекцию и все остальные документы уже подкладываются или подшиваются и хранятся в этом одном деле.

Нет, по гражданскому кодексу.
Обычаем признается сложившееся и широко применяемое в какой-либо области предпринимательской или иной деятельности, не предусмотренное законодательством правило поведения, независимо от того, зафиксировано ли оно в каком-либо документе.

Ого! Вот это открытие

Но договор, заключенный на срок более года, нужно регистрировать. Получается, что бессрочный договор имеет срок действия и его нужно продлевать каждый год )

Что такое учётное дело и где оно хранится?
Или где хранится регистрационное дело тогда?
В Территориальную ИФНС что отправляют? Регистрационное или учётное? Или я понятия путаю?

Gosrt4, вот скажи мне, зачем им 3 экземпляра уведомления о переходе на УСН?

А кто Вам утверждает об этой обязанности?

Согласно ФЗ ОбООО устав общества должен содержать:

• полное и сокращенное фирменное наименование общества;
  
• сведения о месте нахождения общества;
  
• сведения о составе и компетенции органов общества, в том числе о вопросах, составляющих исключительную компетенцию общего собрания участников общества, о порядке принятия органами общества решений, в том числе о вопросах, решения по которым принимаются единогласно или квалифицированным большинством голосов;
  
• сведения о размере уставного капитала общества;
  
• права и обязанности участников общества;
  
• сведения о порядке и последствиях выхода участника общества из общества, если право на выход из общества предусмотрено уставом общества;
  
• сведения о порядке перехода доли или части доли в уставном капитале общества к другому лицу;
  
• сведения о порядке хранения документов общества и о порядке предоставления обществом информации участникам общества и другим лицам;
  
• иные сведения, предусмотренные настоящим Федеральным законом.
  

Устав общества может также содержать иные положения, не противоречащие настоящему Федеральному закону и иным федеральным законам.

Вот наименование должности и включают по обычаю в содержание. Ну это моё мнение

Не могу сказать, что влияло на принятие решения о смене места нахождения компании и переезде в регион.
Также не могу сказать, что повлияло на решение остаться в Москве и сменить юридический адрес.

А в Москве проходит одновременно регистрация смена юридического адреса по 13 форме и приведение в соответствие и при этом без уплаты госпошлины?

А что вводят руками? Я почему-то думал что документы, которые поданы на регистрацию сканируют и программа распознаёт.

Видимо никому не мешает. Вчера попалась на глаза запись в ЕГРЮЛ о предстоящей смене места нахождения из Москвы в Московскую область, внесли которую полгода назад. И ничего, живут и изменения вносят. А сейчас еще и решили сменить юридический адрес в пределах Москвы - переезд в другую налоговую.