Ну вот даже бегать не придётся, за вас всё сделает АС.

А если окажется, что подписи поддельные, то переквалифицируют в уголовное дело или всё обойдётся признанием регистрации ИП недействительной?

Может не утверждены, ни те, ни те

Инициативу "снизу" прояваить, но честно говоря лень. Одно только из количество пугает, хочется сказать да ну их в ... со своими уставами. Разработали будем работать с тем, что есть. Работаем ведь с тем что есть и с тем будем.

Странная ситуация. Его что, без его ведома зарегистрировали в качестве ИП?  
В ЕГРЮЛ есть информация о способе подачи документов? Если по доверености, то запросите копию доверенности из личного дела. Доверенность нотариальная - узнаете ФИО нотариуса. Если нотариус не подельник, то он начнёт тоже суетиться, во всяком случае сможет предоставить какую-то информацию.
Если с ЭЦП, то обращайтесь в налоговую. Также запросите информацию об удостоверяющем центре, который оформил выпуск ЭЦП.

Ну по крайней мере 2 направления уже есть.

Честно говоря такой подход странный - ждать пока исключат. Это же называется пустить на самотёк.
Жизненные ситуации ведь разные бывают. Кто-то срочно выходит из бизнеса, чтобы уйти на госслужбу, а кому-то необходимо срочно зарегистрировать юр лицо именно на себя (типа договоренности об участии в госзакупках).
Брошенная фирма может потом горько аукнуться.

Оформляется решение единственного участника.
А долю общества нужно распределить в течение года, не забывайте.

А Лаврову тоже Вы пишите?

Если через МФЦ подавать, то госпошлина оплачивается.
На сайте налоговой квитанция формируется при этом способе подачи. Значит должна оплачиваться

Или я чего-то не понимаю или вопрос неправильно задан.

Если вы хотите вернуть деньги, потраченные на организацию бизнеса именно в этом помещении, то наверное никак.
Если вы хотите продолжить зарабатывать, снимите другое помещение.
Если вы хотите вернуть деньги за аренду, подайте в суд за невыполнение обязательств по договору, если арендодатель нарушил их.

Регистрация физ лица в качестве ИП происходит по месту прописки. Соответственно документы на регистрацию подаются в Москву. А в Московской области купите Патент. По патенту отчётность не сдаётся.