Согласен, здесь у каждого способа свои преимущества и свои особенности, которые нужно учесть.
При нотариальной сделке можно указать номинальную стоимость, но нотариальное расходы большие.
При дарении у общества образуется налог на доход.
При зачете тоже образуется доход, но может его можно уменьшить, если компания применяет УСН.

В любом случае размер действительной стоимости доли имеет решающее значение. От него и будут производить расчеты.

Мне кажется общество по-любому на налог попадает.
Если услуги оказаны, то ожидается поступление. Зачет требования будет означать поступление дохода, ну а с дохода исчисляется налог, который и должен быть уплачен.
Или я ошибаюсь?

Leon33, кому идти-то, если руководитель самоотстранился? Учредителям?

В этом случае у общества образуется доход и нужно будет уплатить налоги.
Лучше через сделку провести. Но нужно подсчитать все расходы (нотариальные, возможные налоги при дарении и выплате ДСД) при различных сценариях.
Это уже с бухгалтером нужно сидеть разбираться.

Если ваш партнер пойдёт на это, то можно предложить нотариальную сделку по купле-продаже доли в ООО, а в договоре указать номинальную стоимость доли. Тогда рассчитывать и выплачивать действительную стоимость доли не придётся.

Ну так и решили - подавать жалобу через сервис на сайте налоговой - Обратиться в ФНС России

Директор решил подавать жалобу в УФНС на действия налоговых органов, поскольку уверен, что долгов нет, и тратить время на повторные сверки не стоит.
Можно ведь подать Жалобу на действия налоговой инспекции в электронном виде через портал и приложить сканы документов или лучше лично ехать?

А какой срок для обжалования решения налоговой об отказе?
Допустим мы сейчас будем проходить сверку, получим справки примерно недели через 2, а там окажется, что задолженностей нет. Успеем подать на обжалование?

Сегодня получили аналогичный отказ. По имеющемуся примеру решили, что и у нас долги. Но перед подачей сверку проходили, всё нормально было.
Директор поехал в территориальную налоговую инспекцию. Говорит, что был у человека, который отвечает на запросы из 46 налоговой и тот сказал, что сейчас никаких долгов нет. Поехали обратно в 46 в окне консультации сказали, что был получен ответ из местной ИФНС о наличии долгов.
Что за кошки-мышки такие? Кому верить? Что делать дальше не понятно.

Только что от нотариуса. Как раз имеем на руках решение об увеличении и учредительный договор, зарегистрированный МИФНС. В них размер долей в процентах указан. Нотариус сказала, что эти документы подойдут. Будем готовиться к сделке.