А в в пункте 3 статьи 5 этого закона говорится о внесении изменений в 129-ФЗ.
И там написано, что вместо изменений, внесенных в учредительный документ, представляется заявление, содержащее текст изменений, вносимых в учредительный документ.

Вот на этом я сдаюсь. То есть что получается? В устав вносят изменения, но устав в налоговую не дается? А вместо этого в ЕГРЮЛ вносится текст изменений?
Как так получается - Уставный капитал увеличивается и об этом прописано в ЕГРЮЛ, но устав, в который тоже должны быть внесены изменения, в налоговой не регистрируется? фактически остаётся зарегистрированный устав с прежним размером УК.
Как то так.

Жить то как с этим?

Ну разобраться то нужно что это все -таки груша.
А то придёт клиент, скажет - у меня инвестор хочет заключить договор конвертируемого займа.
Вот и нужно будет в этом случае разъяснить клиенту с какими вопросами придется ему столкнуться когда наступить момент 14 дневного раздумья и период жизни после того, как нотариус направит в налоговую заявление об увеличении УК.

Ну да, клиент у тогда нужно об этом говорить почему устанавливается запрет.