В налоговом законодательстве существует запрет на повторную проверку одного и того же периода по одному и тому же налогу (п. 5 ст. 89 НК РФ), это правило действует только для выездных проверок. Если инспекция в ходе выездной проверки проконтролировала период по конкретному налогу, то провести еще одну выездную проверку по этому же периоду в отношении этого же налога она не сможет (но установлены и исключения).
Если инспекция провела камеральную проверку, то этот факт значения не имеет и никакого влияния на период выездной проверки не оказывает. В арбитражной практике есть примеры судебных решений, подтверждающие правомерность этого вывода (см., например, определения ВАС РФ от 27 апреля 2010 г. № ВАС-5083/10, от 19 мая 2009 г. № ВАС-1588/09, постановления ФАС Поволжского округа от 4 марта 2010 г. № А65-26158/2009, Северо-Западного округа от 2 декабря 2008 г. № А52-5071/2007, Дальневосточного округа от 19 мая 2008 г. № Ф03-А04/08-2/1276).
То есть в отношении Вашего вопроса: действия налоговой инспекции законны.