Как-то попадалось из судебной практики, что это оспариваемое рег действие и незаконное, участник имеет право быть восстановлен. Правда не подскажу как налоговая регистрирует или нет. Всё таки до рег органов доводят судебную практику.

Возможность исключения участника из ООО предусмотрена ст. 10 ФЗ-14. Согласно этой норме участники общества, доли которых в совокупности составляют не менее чем 10% УК общества, вправе требовать в судебном порядке исключения из общества участника, который грубо нарушает свои обязанности либо своими действиями или бездействием)делает невозможной деятельность общества или существенно ее затрудняет.

Поэтому подать только 14 форму с приложением выписки может и не решит вопрос. Инспектор может захочет видеть судебное решение в качестве основания исключения участника из ООО.

Если обжаловать так никто и не соберётся, то вам повезло. Но ведь исключенный участник может обжаловать решение и потребовать восстановить его в составе участников. А потом выйти из Общества и потребовать действительную долю. Как вам такой расклад?

Нашёл определение ВАС РФ от 12.05.2008 N 5530/08 по делу N А09-4208/07-5.

В ходе разбирательств судебные инстанции указали на то, что неоплата доли в уставном капитале не является основанием для исключения участника из общества и ВАС отказал в исключении из состава участников.

Такую же позицию занимает ФАС Северо-Кавказского округа:
Постановление ФАС Северо-Кавказского округа от 16.08.2011 по делу N А32-35409/2010.

... в качестве правового последствия невнесения учредителем в срок своего вклада в уставный капитал общества (оплаты доли) в полном размере законом предусмотрен переход доли такого участника к обществу, а не исключение его из общества в порядке статьи 10 Закона об обществах с ограниченной ответственностью...


Так что это всё не однозначно