Техническая возможность у нотариуса есть. Главное чтобы в тексте доверенности была нужная для нотариуса формулировка, то есть у представителя были полномочия представлять интересы общества в нотариальной конторе. Если такая фраза есть в доверенности, то нотариус сможет подать их в электронном виде со своей ЭЦП. Но скажу честно, я такую формулировку не часто встречаю. Посмотрите в своей доверенности, какие полномочия предоставлены представителю.

посмотрел доверенности, которые оформляет знакомый нотариус, так там такой формулировки нет -
"... представлять интересы Общества в компетентных органах, учреждениях и организациях города Москвы, в том числе в территориальных инспекциях ФНС России по городу Москве, МИ ФНС № 46 по городу Москве
по всем вопросам, связанным с государственной регистрацией любых изменений Общества, а также, реорганизацией и/или добровольной ликвидацией Общества,
для чего предоставляет право подавать и получать необходимые документы, в том числе лист записи ЕГРЮЛ, Устав с отметкой налогового органа, выписку из ЕГРЮЛ, уведомление о снятии с учета в территориальной Инспекции ФНС России,
оплачивать все необходимые налоги и пошлины, расписываться от имени Общества и совершать все действия, связанные с выполнением данных поручений..."

Получается с такой через нотариуса не подашь, только ножками.