Ещё вариант произвести зачет требований. Тогда никто никому ничего не будет должен.
Если при выходе общество должно участнику, то для зачета требований должна образоваться задолженность участника перед обществом. Каким образом? Всё зависит от того какие услуги общество может оказать физлицу.

Разработка дизайна квартиры, закатать всю квартиру в фотообои Марка Эванса )
Тогда ещё ваш участник Обществу останется должен

Мне кажется общество по-любому на налог попадает.
Если услуги оказаны, то ожидается поступление. Зачет требования будет означать поступление дохода, ну а с дохода исчисляется налог, который и должен быть уплачен.
Или я ошибаюсь?

Согласен, здесь у каждого способа свои преимущества и свои особенности, которые нужно учесть.
При нотариальной сделке можно указать номинальную стоимость, но нотариальное расходы большие.
При дарении у общества образуется налог на доход.
При зачете тоже образуется доход, но может его можно уменьшить, если компания применяет УСН.

В любом случае размер действительной стоимости доли имеет решающее значение. От него и будут производить расчеты.